האגודה מחלקת מספר פרסים, מלגות ומענקים ליוצרים ישראלים מתוך מטרה לעודד ולתמוך ביצירה בדיונית ישראלית מקורית.

פרס גפן

פרס גפן מוענק מדי שנה לספרים ולסיפורים הטובים ביותר בסוגות המדע הבדיוני והפנטסיה שראו אור בעברית, במטרה לקדם תחום ספרותי זה בישראל. הפרס מוענק מטעם האגודה הישראלית למדע בדיוני ולפנטסיה, והוא קרוי על שמו של עמוס גפן ז"ל – מתרגם, עורך, מחלוצי המדע בדיוני בארץ וממייסדי האגודה. הפרס מחולק מדיי שנה במהלך פסטיבל אייקון. ניתן למצוא פרטים נוספים באתר פרס גפן.

פרס עינת

פרס עינת מוענק מדיי שנה לסיפורים קצרים בסוגות המדע הבדיוני והפנטסיה שטרם פורסמו. לפרס שני מסלולים: מסלול רגיל, ומסלול לכותבים צעירים (עד גיל 18). הפרס מוענק לזכר עינת פלג. הפרס מחולק מדיי שנה במהלך פסטיבל אייקון. ניתן למצוא פרטים נוספים באתר פרס עינת.